Река берёт начало в озере Атлин на севере провинции Британская Колумбия. Далее река течёт по Территории Юкон в северо-западном направлении к границе с Аляской, которую пересекает с востока на запад, деля штат примерно на две равные части. Впадает в залив Нортон Берингова моря. Главные притоки: Танана, Пелли, Поркпайн,Коюкук. До слияния с Пелли течет в глубокой горной долине, образуя пороги. Основное питание реки — снеготаянье. Во время наводнений (июнь-июль) уровень воды в низовьях реки поднимается в некоторых местах на 15—20 м выше своего среднего уровня. Наибольшие расходы воды в поселке Игл (среднее течение) 5000—7000 м3/сек; средние расходы около этого пункта около 2000 м3/сек. Период ледового стояния, со 2-половины октября — 1-й половины ноября до конца апреля — начала мая.